- Thủ tục đối với hàng hóa TNTX, TXTN thực hiện như thủ tục xuất khẩu, nhập khẩu thông thường khác.Tuy nhiên, trên cơ sở mã loại hình khai báo, chỉ tiêu thời hạn TNTX, TXTN, số tờ khai TNTX, TXTN tương ứng và số thứ tự dòng hàng trên tờ khai TNTX, TXTN hệ thống sẽ tự động theo dõi số lượng, thời hạn và thực hiện trừ lùi số lượng. (cụ thể các chỉ tiêu thông tin này có thể tham khảo tại phần chỉ tiêu khai báo tại nghiệp vụ IDA, EDA).

- Trong quá trình thực hiện thủ tục tạm nhập tái xuất, tạm xuất tái nhập, khi phát hiện có sai sót trong quá trình khai báo thì người khai hải quan có thể dùng các nghiệp vụ để sửa đổi những tờ khai hải quan có sai sót.

- Trên hệ thống VNACCS có hỗ trợ một số nghiệp vụ để phục vụ việc quản lý đối với hàng hóa TNTX, TXTN như:

1. Khai bổ sung thông tin quản lý hàng TNTX (TIA)

2. Gọi (gọi tờ khai cần sửa đổi) để khai bổ sung thông tin quản lý tạm nhập - tái xuất (TIB)

3. Tham chiếu thông tin quản lý hàng TNTX (ITI)

Sơ đồ nghiệp vụ khai sửa đổi, bổ sung đối với hàng tạm nhập - tái xuất: